1999-2008,是医院历史上发展最好的时期。十年间,器官移植、介入治疗、微创手术、辅助生殖、激光与现代影像等一系列高精尖技术日臻成熟,给广大患者带来了福音。外科大楼、门急诊医技大楼的建成使用,极大地改善了就医环境。徐州医学院麻醉学硕士培养基地、中南大学临床医学研究生培养基地挂牌运行,使医院学术水平迈上了新的台阶。